Pour exploiter les résultats capturés à l’aide des équipements de la plateforme, vous pourriez avoir besoin de logiciels spécifiques. Vous trouverez, ci-dessous, un tableau pour vous aider dans le choix du logiciel suivi d’une présentation rapide et un lien pour les télécharger.

ImageJ est un logiciel d’analyse d’image open source et donc très personnalisable. C’est un logiciel en constante évolution grâce au travail de la communauté qui vous permettra de chercher les plug-ins pour répondre à vos besoins ou de les créer pour proposer une nouvelle solution à la communauté. Il existe des packages d’ImageJ déjà couplés avec d’autres plug-ins tels que Fiji ou ImageJ2.

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Fiji est un logiciel d’analyse d’image utilisant ImageJ2 couplé avec de nombreux plug-ins pour faciliter l’analyse d’image. C’est un logiciel accessible, avec une fonction de mise à jour automatique et auquel vous pourrez coupler des plug-ins pour répondre au mieux à vos objectifs.

Pour les développeurs, Fiji est un logiciel open source qui facilite le développement de nouveaux plug-ins pour répondre à vos besoins.

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OlyVIA est un logiciel gratuit d’analyse d’image développé par Olympus permettant de lire des données acquises par le scanner de lames VS200 et sur les microscopes confocaux de la série FV3000. OlyVIA propose une interface utilisateur intuitive, facilite le partage d’images, permet de passer d’une micro à une macro-observation de l’image et de comparer des lames numériques côte-à-côtes.

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Fluoview est un logiciel d’analyse d’images utilisé pour les images acquises sur les microscopes Olympus FV3000 ou FVMPE-RS. Ce logiciel permet de simplifier la visualisation et l’analyse de grandes acquisitions multi-dimensionnelles. Il permet également d’exporter vos acquisitions dans des formats d’images plus généraux (.bitmap, .jpeg, .png, .tiff, .wmv, .oif, .oib, FluoView Multi-TIFF). Vous pourrez trouver une introduction à son utilisation dans la vidéo suivante :

Télécharger Fluoview

Imaris est un logiciel d’analyse d’images qui se concentre sur l’imagerie 3D et 4D. Il existe différents Packages d’Imaris afin de coller au mieux aux objectifs de vos recherches. Vous pouvez identifier le package qui correspondra le mieux à vos objectifs sur le Learning center. Imaris est un logiciel payant mais vous pouvez demander à avoir une période d’essai gratuite. Vous pouvez également télécharger gratuitement le viewer d’Imaris. La plateforme ImageUP possède également de deux PC avec la licence Imaris.

Demander une période d’essai à Imaris

Télécharger le viewer Imaris gratuit

FlowJo est un logiciel d’analyse utilisé pour les données de cytométrie. Ce logiciel permet d’interpréter rapidement vos données avec des outils accessibles pour l’immunophénotypage, l’analyse de cycles cellulaires, la prolifération, les études cinétiques, les comparaisons quantitatives de populations, l’analyse en haute dimension, et plus encore. Ce logiciel est compatible avec tous types de fichiers des packages de logiciels d’acquisition et de cytomètres.

Télécharger FlowJo

Cell Sens est un logiciel développé par Olympus proposant diverses versions : Dimension, Standard et Entry. Cell Sens Entry est un package offrant aux chercheurs des outils pour acquérir et documenter les captures numériques. Cell Sens Standard est fondé sur Entry et permet l’acquisition d’images multiples au moyen de processus de saisie d’image avancés et du contrôle des composants de microscopes motorisés et codés. Enfin, Dimension est le progiciel le plus polyvalent puisqu’il propose une fonction d’acquisition d’images entièrement automatisée et de puissants outils d’analyse.

Les différentes versions de Cell Sens sont des progiciels, ce qui signifie qu’ils peuvent être configurés pour évoluer et s’adapter au mieux à vos besoins.

Télécharger Cell Sens

Amira est un logiciel d’imagerie avancé utilisé pour visualiser et analyser des données volumétriques complexes, telles que des images médicales, des données de microscopie ou des modèles 3D. Amira offre un large éventail de fonctionnalités pour l’analyse d’images en microscopie électronique à balayage, permettant aux utilisateurs de segmenter les structures, d’extraire des données quantitatives et de visualiser les structures en 3D, ce qui en fait un outil puissant pour l’analyse d’images en microscopie électronique à balayage. Amira dispose également de fonctionnalités pour la visualisation et l’analyse de données enregistrées à partir de MEB en temps réel, ce qui permet aux utilisateurs de suivre les changements dynamiques dans l’échantillon en temps réel.

Amira est un logiciel payant, mais vous pouvez demandez un essai gratuit en remplissant ce formulaire. Une version est également installée sur le PC d’ImageUP proposant la MEB 3D.