Le département de « Biologie de Organismes et des Populations » est responsable des parcours « Écologie et Biologie des Organismes » de la licence et « Écologie et Biologie des Populations » du master. Il coordonne également un master européen (Label Erasmus Mundus) « European Master in Applied Ecology » adossé au master EBP.

Tous les enseignants-chercheurs, chercheurs et personnels techniques participent à ces formations. Des étudiants en thèse ainsi que de nombreux partenaires extérieurs interviennent également dans les enseignements.